由于微機線路保護裝置是由各種電子元器件和CPU芯片組成的弱電工作回路，很容易受到外界諧波、強雷電波及無線電波的干擾，導致裝置程序運行出錯、死機、拒動或誤動等不正常情況。因此，微機保護裝置的抗干擾措施非常重要。除了全面執行原電力部1994年頒發的《電力系統繼電保護及安全自動裝置反事故措施要點》及1996年原電力部頒發的《微機繼電保護裝置運行管理規程》的有關規定，嚴格按照有關規程、反措進行設計、施工和驗收外，廣州電力局還要求生產廠家對端子排的正電源與跳閘回路必須隔開3個端子排的距離，防止人為誤碰或端子排老化、絕緣降低，導致控制回路誤發跳閘信號事故。嚴格執行“不允許用電纜芯兩端同時接地的方法作為抗干擾措施”。繼保運行人員在進行維護工作時必須嚴格檢查這些措施的落實情況，確保接地點接地可靠，裝置的抗干擾盒工作正常。

隨著現代社會通訊工具的普及，繼保運行人員隨身攜帶的手機、無線電對講機等通訊工具對微機保護裝置也會產生一定的影響。因此必須在保護安裝處以及有可能使用這些通訊工具的場所，用它們發出的無線電信號對有關保護裝置進行干擾試驗。如果保護屏使用鐵門封閉的，應分別在鐵門關閉及打開的情況下進行干擾試驗。試驗時保護裝置不允許出現任何異常現象，否則要求廠家立即處理，并全面檢查執行規程、反措要求情況，絕不能馬虎了事走過場。